{"id":18334,"date":"2023-09-25T12:37:57","date_gmt":"2023-09-25T12:37:57","guid":{"rendered":"https:\/\/www.africa-press.net\/djibouti\/politique\/un-nouveau-virus-decouvert-a-8900-metres-dans-les-profondeurs-de-la-fosse-des-mariannes"},"modified":"2023-09-25T13:46:45","modified_gmt":"2023-09-25T13:46:45","slug":"un-nouveau-virus-decouvert-a-8900-metres-dans-les-profondeurs-de-la-fosse-des-mariannes","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.africa-press.net\/djibouti\/toutes-les-actualites\/un-nouveau-virus-decouvert-a-8900-metres-dans-les-profondeurs-de-la-fosse-des-mariannes","title":{"rendered":"Un nouveau virus d\u00e9couvert \u00e0 8900 m\u00e8tres, dans les profondeurs de la fosse des Mariannes"},"content":{"rendered":"

Africa-Press – Djibouti. <\/strong><\/span>La fosse des Mariannes, fascinante empreinte de la tectonique des plaques, re\u0301ve\u0300le tre\u0300s progressivement ses secrets. Il faut dire que ce gouffre repre\u0301sente le point le plus profond de la crou\u0302te terrestre. A l\u2019est de l\u2019archipel des Philippines, il s\u2019enfonce sur 11.000 me\u0300tres. Si vous pouviez vous y engouffrer, vous y croiseriez, au fur et a\u0300 mesure de votre progression vers les grands fonds, des espe\u0300ces exceptionnelles : un poisson a\u0300 la te\u0302te comple\u0300tement transparente, le Barreleye du Pacifique, puis une pieuvre translucide, l\u2019amphitretus pelagicus, et enfin, le de\u0301nomme\u0301 vB_HmeY_H4907. C\u2019est le petit nom du nouveau virus de\u0301couvert a\u0300 8 900 me\u0300tres de profondeur, par une e\u0301quipe de chercheurs de l\u2019universite\u0301 oce\u0301anique de Chine. Leurs re\u0301sultats ont e\u0301te\u0301 publie\u0301s dans la revue Microbiology Spectrum.<\/p>\n

Un virus e\u0301merge des profondeurs<\/b><\/p>\n

\u00ab\u00a0Ce n\u2019est pas e\u0301tonnant ! La\u0300 ou\u0300 il y a de la vie, il y a des virus\u00a0\u00bb, s\u2019exclame Martial Marbouty, chercheur au CNRS, pour Sciences et Avenir. A pre\u0300s de 9 000 me\u0300tres de profondeur, l\u2019e\u0301quipe de Yantao Liang effectue un pre\u0301le\u0300vement sur la couche se\u0301dimentaire de la fosse des Mariannes. De retour au laboratoire, les biologistes identifient dans l\u2019e\u0301chantillon des bacte\u0301ries, Halomonas meridiana. Ils s\u2019interrogent alors sur une possible infection de cette bacte\u0301rie, par un virus : une situation tre\u0300s fre\u0301quente. \u00ab\u00a0Chaque jour, entre 15 et 40% de la masse bacte\u0301rienne oce\u0301anique est infecte\u0301e puis lyse\u0301e, c\u2019est-a\u0300-dire tue\u0301e, par des virus bacte\u0301riophages\u00a0\u00bb, indique Martial Marbouty. Ce sont des virus spe\u0301cialise\u0301s, qui s\u2019attaquent aux bacte\u0301ries : on les appelle les phages. Ils sont ge\u0301ne\u0301ralement spe\u0301cifiques d\u2019une seule espe\u0300ce de bacte\u0301rie.<\/p>\n

Le phage, pre\u0301dateur des bacte\u0301ries<\/b><\/p>\n

Comme le virus pour des cellules, le phage reconnai\u0302t un re\u0301cepteur a\u0300 la surface de la bacte\u0301rie, et s\u2019y fixe. Il injecte son ge\u0301nome a\u0300 l\u2019inte\u0301rieur de la bacte\u0301rie. \u00ab\u00a0Le mate\u0301riel ge\u0301ne\u0301tique qu\u2019il inte\u0300gre a\u0300 la bacte\u0301rie peut e\u0302tre un bout d\u2019ADN, ou bien d\u2019ARN, a\u0300 double brin, ou simple brin, cela de\u0301pend du phage\u00a0\u00bb, explique Martial Marbouty. S\u2019amorce alors une course contre-la-montre entre le syste\u0300me immunitaire de la bacte\u0301rie et le syste\u0300me infectieux du phage. L\u2019inte\u0301re\u0302t pour le virus ? De\u0301tourner toute la machinerie cellulaire de la bacte\u0301rie, a\u0300 son profit. Ce qui lui permet de se multiplier.<\/p>\n

Il existe deux types de phages. Les uns sont dits \u00ab\u00a0virulents\u00a0\u00bb, ils se reproduisent et abandonnent la bacte\u0301rie en la tuant. Leur cycle est appele\u0301 \u00ab\u00a0lytique\u00a0\u00bb. A l\u2019inverse, il existe des phages \u00ab\u00a0tempe\u0301re\u0301s\u00a0\u00bb. Celui-ci passe inaperc\u0327u dans la cellule. \u00ab\u00a0Il se multiplie gra\u0302ce a\u0300 son ho\u0302te. Chaque fois que la bacte\u0301rie se re\u0301plique, il se re\u0301plique e\u0301galement car il est comple\u0300tement inte\u0301gre\u0301\u00a0\u00bb, de\u0301taille le virologue. Il est totalement passif. On parle alors de cycle lysoge\u0301nique. Toutefois, ces phages sont aussi capables de prendre le contro\u0302le de la bacte\u0301rie et de la tuer si elle fait face a\u0300 un stress trop e\u0301leve\u0301, du\u0302 a\u0300 l\u2019environnement par exemple.<\/p>\n

\u00ab\u00a0On trouve des traces des phages partout\u00a0\u00bb<\/b><\/p>\n

Pour identifier l\u2019infection potentielle, les chercheurs ont confronte\u0301 la bacte\u0301rie a\u0300 une substance chimique (Mytomicine C), provoquant un stress de l\u2019organisme. \u00ab\u00a0Pour le phage, c\u2019est un peu comme si sa maison prenait feu. Il passe alors en cycle lytique : il tue la bacte\u0301rie et en sort\u00a0\u00bb, re\u0301sume Martial Marbouty. Les biologistes peuvent ainsi identifier le virus, jusqu\u2019alors inconnu. Ses donne\u0301es ge\u0301ne\u0301tiques permettent me\u0302me aux chercheurs de lui attribuer une nouvelle famille rien qu\u2019a\u0300 lui : les Suviridae, adeptes des profondeurs oce\u0301aniques. Toutefois, ce n\u2019est pas la premie\u0300re fois qu\u2019un phage de la grande famille des siphovirus, dont celui-ci fait aussi partie, est identifie\u0301 dans l\u2019oce\u0301an.<\/p>\n

A vrai dire, ces virus sont pre\u0301sents partout ! Me\u0302me… dans notre intestin ! \u00ab\u00a0Chaque fois qu\u2019on analyse le ge\u0301nome d\u2019un environnement, on trouve des traces de ces phages\u00a0\u00bb, explique le virologue. Mais difficile pour les scientifiques d\u2019identifier le phage a\u0300 coup su\u0302r : souvent, ils ne disposent que de fragments de son ADN. \u00ab\u00a0Actuellement, on essaie de de\u0301velopper des outils qui seraient capables de reconstituer le ge\u0301nome complet de ces phages\u00a0\u00bb, ajoute-t-il.<\/p>\n

Re\u0301gulateur de biodiversite\u0301<\/b><\/p>\n

Les phages ont un impact conside\u0301rable sur toute la vie bacte\u0301rienne. D\u2019abord, ils en sont un pre\u0301dateur fe\u0301roce puisqu\u2019ils sont responsables d\u2019un quart des lyses de bacte\u0301ries, aboutissant a\u0300 leur mort. Le syste\u0300me immunitaire des bacte\u0301ries e\u0301volue donc en permanence pour lutter contre les phages, tandis que ces derniers renouvellent aussi leur technique d\u2019infection : \u00ab\u00a0C\u2019est une ve\u0301ritable course a\u0300 l\u2019armement\u00a0\u00bb, sourit Martial Marbouty.<\/p>\n

Par ailleurs, comme tous les virus, les phages sont a\u0300 l\u2019origine d\u2019un vaste brassage des ge\u0300nes des cellules qu\u2019ils infectent. \u00ab\u00a0Quand le phage se multiplie, et quitte la cellule, il peut emporter avec lui des se\u0301quences d\u2019ADN de son ho\u0302te et les inte\u0301grer dans les bacte\u0301ries qu\u2019il infecte par la suite\u00a0\u00bb, pre\u0301cise le biologiste. C\u2019est ce qu\u2019on appelle le transfert horizontal de ge\u0300nes.<\/p>\n

Les phages, utiles pour soigner l\u2019e\u0302tre humain<\/b><\/p>\n

La capacite\u0301 des phages a\u0300 tuer des bacte\u0301ries bien pre\u0301cises a me\u0302me de\u0301ja\u0300 e\u0301te\u0301 utilise\u0301e pour soigner les Hommes. \u00ab\u00a0L\u2019ave\u0300nement des antibiotiques, plus faciles a\u0300 utiliser, a fait tomber les phages dans l\u2019oubli, mais on sait depuis longtemps qu\u2019ils peuvent e\u0302tre tre\u0300s efficaces en cas d\u2019infection bacte\u0301rienne\u00a0\u00bb, e\u0301claire Martial Marbouty. Aujourd\u2019hui, la re\u0301sistance croissante des bacte\u0301ries a\u0300 ces me\u0301dicaments ravive l\u2019inte\u0301re\u0302t des scientifiques pour ces petits virus spe\u0301cialise\u0301s. Leur fonctionnement est bien plus pre\u0301cis que celui des antibiotiques. Ces derniers s\u2019attaquent a\u0300 toutes les bacte\u0301ries, conduisant les me\u0301decins a\u0300 prescrire la prise de levures ou de probiotiques pour e\u0301viter les maux d\u2019estomac. En revanche, le phage ne cible qu\u2019une seule espe\u0300ce de bacte\u0301rie.<\/p>\n

De nouvelles recherches permettront de comple\u0301ter les connaissances des scientifiques sur les phages et leur ge\u0301nome, et en apprendre davantage sur son incidence au sein d\u2019e\u0301cosyste\u0300mes aussi varie\u0301s : des profondeurs des mers, jusqu\u2019au microbiote intestinal.<\/p>\n

Pour plus d’informations et d’analyses sur la Djibouti<\/a>, suivez Africa-Press<\/a><\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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