{"id":10515,"date":"2021-12-16T20:24:38","date_gmt":"2021-12-16T20:24:38","guid":{"rendered":"https:\/\/www.africa-press.net\/mali\/politique\/omicron-dou-vient-ce-variant-et-pourquoi-est-ce-important"},"modified":"2021-12-16T22:36:04","modified_gmt":"2021-12-16T22:36:04","slug":"omicron-dou-vient-ce-variant-et-pourquoi-est-ce-important","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.africa-press.net\/mali\/homepage-french\/omicron-dou-vient-ce-variant-et-pourquoi-est-ce-important","title":{"rendered":"Omicron : d’o\u00f9 vient ce variant et pourquoi est-ce important ?"},"content":{"rendered":"

Africa-Press – Mali. <\/strong><\/span>Lorsque des scientifiques d’Afrique du Sud ont d\u00e9couvert Omicron, le nouveau variant du Covid-19, plusieurs \u00e9l\u00e9ments ont \u00e9t\u00e9 mis en \u00e9vidence.<\/p>\n

Le premier et le plus important \u00e9tait le nombre consid\u00e9rable de mutations que pr\u00e9sentait cette version du virus – une combinaison de mutations qui n’avait pas encore \u00e9t\u00e9 d\u00e9tect\u00e9e par la surveillance g\u00e9n\u00e9tique effectu\u00e9e par un r\u00e9seau mondial d’experts.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Omicron est arriv\u00e9 avec quelque chose de compl\u00e8tement diff\u00e9rent\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 \u00e0 la BBC le Dr Richard Lessells, sp\u00e9cialiste des maladies infectieuses \u00e0 l’universit\u00e9 du KwaZulu-Natal et membre de l’\u00e9quipe qui a \u00e9t\u00e9 la premi\u00e8re \u00e0 d\u00e9tecter le variant fin novembre.<\/p>\n

Lessells et ses coll\u00e8gues ont estim\u00e9 que quelque chose d’inhabituel s’\u00e9tait produit.<\/p>\n

Ils pensent qu’Omicron a pu surprendre tout le monde en \u00e9voluant chez une seule personne au syst\u00e8me immunitaire affaibli en Afrique subsaharienne – peut-\u00eatre une personne atteinte du VIH non trait\u00e9 – avant de se propager dans plus de 40 pays.<\/p>\n

Bien qu’il existe au moins deux autres explications viables pour l’\u00e9mergence de cette variante, l’hypoth\u00e8se d’une seule personne b\u00e9n\u00e9ficie d’un soutien important au sein de la communaut\u00e9 scientifique.<\/p>\n

Mais pourquoi est-il important de savoir d’o\u00f9 vient Omicron, et comment il est apparu ?<\/p>\n

Les origines d’Omicron<\/b><\/p>\n

Nous ne savons pas exactement o\u00f9 Omicron a \u00e9volu\u00e9 ni dans quelles circonstances, si ce n’est que le nouveau variant a \u00e9t\u00e9 signal\u00e9 pour la premi\u00e8re fois \u00e0 l’Organisation mondiale de la sant\u00e9 en Afrique du Sud le 24 novembre.<\/p>\n

Mais il est important pour les scientifiques et les experts de la sant\u00e9 publique de savoir o\u00f9 et quand un variant appara\u00eet, car cela permet d’orienter les tentatives visant \u00e0 contenir la transmission du virus, qui peuvent inclure des mesures telles que le confinement ou les restrictions de voyage (bien que ces mesures aient \u00e9t\u00e9 critiqu\u00e9es pour leur inefficacit\u00e9).<\/p>\n

Plus t\u00f4t un nouveau variant est d\u00e9tect\u00e9, plus nous avons de temps pour d\u00e9terminer sa gravit\u00e9 – est-il plus transmissible ? Se r\u00e9plique-t-il plus rapidement chez une personne infect\u00e9e ? Provoque-t-il des maladies plus graves ? Peut-il \u00e9chapper aux d\u00e9fenses immunitaires de l’organisme ?<\/p>\n

Le \u00ab\u00a0comment\u00a0\u00bb est tout aussi crucial : si Omicron a r\u00e9ellement \u00e9volu\u00e9 au sein d’un seul patient dont le syst\u00e8me immunitaire est compromis, cela signifierait que le suivi de ces individus deviendrait extr\u00eamement important pour la lutte contre le Covid.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Nous disposons d\u00e9sormais de davantage de donn\u00e9es sugg\u00e9rant le lien entre les variants et les personnes immunod\u00e9prim\u00e9es souffrant d’infections chroniques par le Covid\u00a0\u00bb, d\u00e9clare le Dr Larry Corey, virologue au Fred Hutchinson Cancer Research Center de Seattle, bas\u00e9 aux \u00c9tats-Unis.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Mais ces personnes ne sont pas (encore) apparues comme un \u00e9l\u00e9ment important des strat\u00e9gies de pr\u00e9vention du Covid.\u00a0\u00bb<\/p>\n

Comment le virus a-t-il pu \u00e9voluer chez une seule personne ?<\/b><\/p>\n

Les scientifiques disent qu’ils disposent d’une s\u00e9rie d’indices pour faire des \u00ab\u00a0suppositions \u00e9clair\u00e9es\u00a0\u00bb sur la fa\u00e7on dont Omicron est apparu.<\/p>\n

Le Dr Lessells note qu’Omicron diff\u00e8re consid\u00e9rablement des variants existants.<\/p>\n

\u00ab\u00a0L’analyse g\u00e9n\u00e9tique a montr\u00e9 qu’il se situe sur une branche totalement diff\u00e9rente de l’arbre g\u00e9n\u00e9alogique\u00a0\u00bb.<\/p>\n

Plus important encore, la lign\u00e9e d’Omicron ne pr\u00e9sente pas de traces de mutations interm\u00e9diaires plus r\u00e9centes. La version la plus proche, selon Lessells, date de la mi-2020.<\/p>\n

Cette lacune sugg\u00e8re que l’Omicron fortement mut\u00e9 a \u00e9volu\u00e9 \u00ab\u00a0sous le radar\u00a0\u00bb, d\u00e9clare Fran\u00e7ois Balloux, professeur de syst\u00e8mes de biologie computationnelle \u00e0 l’University College London.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Il a surgi de nulle part\u00a0\u00bb, ajoute Balloux. Et il est tr\u00e8s, tr\u00e8s diff\u00e9rent.<\/p>\n

Les analyses d’Omicron ont r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que la nouvelle souche pr\u00e9sente 50 mutations, dont plus de 30 dans la prot\u00e9ine spike, une partie du virus qui d\u00e9finit la mani\u00e8re dont il interagit avec les d\u00e9fenses de l’organisme.<\/p>\n

Le variant Delta, en comparaison, ne pr\u00e9sentait que sept mutations de la prot\u00e9ine spike.<\/p>\n

Alors comment ce nouveau variant a-t-il pu diverger aussi radicalement de ses pr\u00e9d\u00e9cesseurs sans que nous nous en apercevions ?<\/p>\n

Alors que la plupart des gens \u00e9liminent le Sars-Cov-2 de leur organisme en peu de temps, des \u00e9tudes men\u00e9es dans le monde entier ont montr\u00e9 que le virus peut persister beaucoup plus longtemps chez les personnes dont le syst\u00e8me immunitaire est affaibli – les patients atteints de maladies comme le VIH ou le cancer, ou les personnes ayant subi une transplantation d’organe, par exemple.<\/p>\n

Avec moins de r\u00e9sistance de la part de son h\u00f4te, le virus a une chance d’acqu\u00e9rir un certain nombre de mutations qui n\u00e9cessiteraient normalement une circulation plus large au sein d’une population.<\/p>\n

En d\u00e9cembre 2020, des chercheurs de l’universit\u00e9 de Cambridge ont tir\u00e9 la sonnette d’alarme lorsqu’ils ont d\u00e9tect\u00e9 que les \u00e9chantillons d’un patient britannique atteint d’un cancer et d\u00e9c\u00e9d\u00e9 de Covid-19 en ao\u00fbt pr\u00e9sentaient l’\u00e9mergence d’une mutation cl\u00e9 \u00e9galement observ\u00e9e dans Alpha, la premi\u00e8re \u00ab\u00a0variante pr\u00e9occupante\u00a0\u00bb reconnue par l’OMS et signal\u00e9e initialement en septembre de l’ann\u00e9e derni\u00e8re dans le m\u00eame pays.<\/p>\n

Le patient \u00e9tait d\u00e9c\u00e9d\u00e9 101 jours apr\u00e8s son diagnostic initial.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Une infection typique \u00e0 coronavirus ne dure que sept jours et ce n’est pas assez de temps pour que le virus s’adapte et \u00e9volue, car le syst\u00e8me immunitaire le combat\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 \u00e0 la BBC le professeur Ravi Gupta, de l’Institut d’immunologie th\u00e9rapeutique et de maladies infectieuses de Cambridge, qui a dirig\u00e9 les recherches.<\/p>\n

Le professeur Gupta explique que l’infection chronique permise par un syst\u00e8me immunitaire affaibli donne au virus une plus grande marge de man\u0153uvre.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Il faut un syst\u00e8me immunitaire handicap\u00e9 ou partiellement handicap\u00e9 pour que le virus se d\u00e9veloppe\u00a0\u00bb, ajoute-t-il.<\/p>\n

En juin dernier, le Dr Lessells et ses coll\u00e8gues ont annonc\u00e9 les r\u00e9sultats d’une \u00e9tude portant sur des \u00e9chantillons de coronavirus pr\u00e9lev\u00e9s sur une femme d’Afrique du Sud atteinte du VIH non trait\u00e9.<\/p>\n

Lors d’analyses g\u00e9n\u00e9tiques r\u00e9p\u00e9t\u00e9es des \u00e9chantillons, ils ont constat\u00e9 des \u00ab\u00a0changements d’\u00e9tape significatifs\u00a0\u00bb dans l’\u00e9volution du virus.<\/p>\n

Les chercheurs ont averti que cela pourrait repr\u00e9senter le d\u00e9but d’une crise de sant\u00e9 publique : dans un article publi\u00e9 le 1er d\u00e9cembre dans la revue scientifique Nature, le Dr Lessells et ses coll\u00e8gues ont estim\u00e9 qu’environ huit millions de personnes s\u00e9ropositives en Afrique subsaharienne ne re\u00e7oivent pas actuellement de traitement antir\u00e9troviral efficace – un nombre qui inclut des personnes qui n’ont jamais \u00e9t\u00e9 test\u00e9es pour la maladie.<\/p>\n

Si le Dr Lessells et le professeur Gupta ont raison, cela repr\u00e9sente un terrain id\u00e9al pour la cr\u00e9ation de nouveaux variants.<\/p>\n

Autres th\u00e9ories<\/b><\/p>\n

Les scientifiques affirment qu’il existe deux autres hypoth\u00e8ses plausibles pour les origines d’Omicron.<\/p>\n

L’une d’elles serait une source animale, c’est-\u00e0-dire que le virus aurait infect\u00e9 une population animale inconnue et aurait mut\u00e9 en son sein avant de se propager \u00e0 l’homme, comme l’a fait le virus Sars-CoV-2 original, selon un rapport de l’OMS publi\u00e9 en mars.<\/p>\n

Cependant, le Dr Larry Corey explique que les analyses g\u00e9n\u00e9tiques d’Omicron effectu\u00e9es jusqu’\u00e0 pr\u00e9sent sugg\u00e8rent qu’il a \u00e9volu\u00e9 chez un humain.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Les donn\u00e9es sugg\u00e8rent que cette hypoth\u00e8se (celle de la transmission par l’animal) est loin d’\u00eatre aussi probable\u00a0\u00bb, d\u00e9clare le Dr Corey.<\/p>\n

Le professeur Balloux ajoute que son \u00e9quipe n’a pas trouv\u00e9 de \u00ab\u00a0pistolet fumant\u00a0\u00bb li\u00e9 \u00e0 la transmission par les animaux.<\/p>\n

Une deuxi\u00e8me hypoth\u00e8se concernant les origines d’Omicron est qu’il a \u00e9volu\u00e9 non pas au sein d’un individu mais d’une population dans une r\u00e9gion o\u00f9 il n’y a pas eu beaucoup de surveillance g\u00e9n\u00e9tique, comme c’est le cas dans de nombreux pays africains, avant d’atteindre l’Afrique du Sud.<\/p>\n

Le Dr Atila Iamarino, biologiste br\u00e9silien et chercheur ind\u00e9pendant, pense que cela pourrait \u00eatre le cas d’Omicron.<\/p>\n

Iamarino voit des parall\u00e8les avec l’\u00e9mergence d’un autre variant pr\u00e9occupant, le variant Gamma, qui a provoqu\u00e9 une infection g\u00e9n\u00e9ralis\u00e9e dans la ville br\u00e9silienne de Manaus, la plus peupl\u00e9e de la r\u00e9gion amazonienne, au d\u00e9but de 2021.<\/p>\n

\u00ab\u00a0La m\u00eame hypoth\u00e8se d’une \u00e9volution du virus chez une seule personne dont le syst\u00e8me immunitaire \u00e9tait affaibli a \u00e9t\u00e9 soulev\u00e9e lors de la d\u00e9tection du Gamma\u00a0\u00bb, pr\u00e9cise le biologiste.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Mais il a \u00e9t\u00e9 prouv\u00e9 par la suite que des lign\u00e9es interm\u00e9diaires \u00e9taient en circulation sans avoir \u00e9t\u00e9 d\u00e9tect\u00e9es et qu’elles accumulaient des mutations en se propageant dans la population locale.\u00a0\u00bb<\/p>\n

Iamarino pense que des recherches suppl\u00e9mentaires pourraient r\u00e9v\u00e9ler le m\u00eame sc\u00e9nario avec Omicron.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Cela correspond \u00e0 la r\u00e9alit\u00e9. Omicron a \u00e9t\u00e9 d\u00e9tect\u00e9 sur un continent o\u00f9 les tests et la surveillance sont moindres que dans le reste du monde.\u00a0\u00bb<\/p>\n

\u00ab\u00a0Il se peut qu’Omicron circule en Afrique depuis bien plus longtemps que ce que nous croyons actuellement\u00a0\u00bb, ajoute-t-il.<\/p>\n

Trouvera-t-on un jour le patient z\u00e9ro ?<\/b><\/p>\n

Les partisans de la \u00ab\u00a0th\u00e9orie de la personne unique\u00a0\u00bb se gardent bien d’\u00e9carter totalement ces alternatives, mais estiment que le poids des preuves joue en leur faveur.<\/p>\n

Trouverons-nous un jour la premi\u00e8re personne porteuse de la variante Omicron ?<\/p>\n

Le patient z\u00e9ro est un terme utilis\u00e9 pour d\u00e9crire le premier humain infect\u00e9 par une maladie virale ou bact\u00e9rienne.<\/p>\n

L’identification de la premi\u00e8re personne infect\u00e9e par un foyer particulier d’une maladie est importante car elle peut aider \u00e0 r\u00e9pondre \u00e0 des questions cruciales sur le comment, le quand et le pourquoi de son apparition.<\/p>\n

Ces r\u00e9ponses peuvent contribuer \u00e0 emp\u00eacher que d’autres personnes soient infect\u00e9es aujourd’hui ou lors de futures \u00e9pid\u00e9mies.<\/p>\n

Mais jusqu’\u00e0 pr\u00e9sent, les scientifiques n’ont pas identifi\u00e9 cet individu – ni pour Omicron ni pour aucun des variants existants.<\/p>\n

Richard Lessells pense qu’il est tr\u00e8s peu probable que le patient z\u00e9ro d’Omicron soit un jour retrouv\u00e9.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Il faudra que la balance des preuves penche en faveur de l’une ou l’autre de ces possibilit\u00e9s (d’origine)\u00a0\u00bb, dit-il, mais il voit des avantages \u00e0 ne pas attribuer l’origine du variant \u00e0 un individu particulier.<\/p>\n

\u00ab\u00a0L’une des choses que nous ne voulons pas faire est d’ajouter \u00e0 la stigmatisation et \u00e0 la discrimination auxquelles sont expos\u00e9es les personnes vivant avec le VIH\u00a0\u00bb, dit-il.<\/p>\n

M. Lessells estime plut\u00f4t que l’hypoth\u00e8se d’une \u00ab\u00a0personne unique\u00a0\u00bb devrait \u00eatre une raison suppl\u00e9mentaire d’intensifier les vaccinations en Afrique, et il n’est pas le seul \u00e0 penser que les personnes non vaccin\u00e9es repr\u00e9sentent une priorit\u00e9 urgente pour les responsables de la sant\u00e9 publique.<\/p>\n

Our World in Data, une collaboration entre l’universit\u00e9 d’Oxford et une organisation caritative \u00e9ducative, a estim\u00e9 \u00e0 la mi-novembre que moins de 7 % des Africains \u00e9taient enti\u00e8rement vaccin\u00e9s, alors que ce chiffre est de 40 % au niveau mondial.<\/p>\n

Le Dr Michael Head, chercheur principal en sant\u00e9 mondiale \u00e0 l’universit\u00e9 de Southampton, au Royaume-Uni, estime que nous devrions accorder plus d’attention \u00e0 ce d\u00e9ploiement in\u00e9gal des vaccins si nous voulons pr\u00e9venir l’\u00e9mergence de variants du Covid.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Comme pour tout ce qui concerne le Covid, il y aura une s\u00e9rie de facteurs qui contribueront \u00e0 l’apparition de nouveaux variants, mais l’in\u00e9galit\u00e9 des vaccins est certainement l’une des raisons principales. Je pense qu’Omicron est une cons\u00e9quence de cette iniquit\u00e9 en Afrique.\u00a0\u00bb<\/p>\n

M. Head affirme qu’Omicron est \u00ab\u00a0un autre signal d’alarme\u00a0\u00bb pour une meilleure couverture vaccinale et que le d\u00e9s\u00e9quilibre vaccinal actuel \u00ab\u00a0donne au Covid-19 des opportunit\u00e9s de prosp\u00e9rer\u00a0\u00bb.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Si vous n’\u00eates pas vaccin\u00e9, vous serez plus susceptible d’\u00eatre plus gravement malade et pendant une plus longue p\u00e9riode\u00a0\u00bb, dit-il.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Cela signifie \u00e9galement que le virus a plus de chances de d\u00e9velopper de nouvelles mutations, ce qui augmente le risque d’un nouveau variant pr\u00e9occupant et la n\u00e9cessit\u00e9 pour nous d’apprendre une autre lettre de l’alphabet grec.\u00a0\u00bb<\/p>\n

Pour plus d’informations et d’analyses sur la Mali<\/a>, suivez Africa-Press<\/a><\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Africa-Press – Mali. Lorsque des scientifiques d’Afrique du Sud ont d\u00e9couvert Omicron, le nouveau variant du Covid-19, plusieurs \u00e9l\u00e9ments ont \u00e9t\u00e9 mis en \u00e9vidence. 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