{"id":65621,"date":"2025-02-20T12:00:00","date_gmt":"2025-02-20T12:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.africa-press.net\/senegal\/politique\/a-la-decouverte-du-microbiote-pulmonaire"},"modified":"2025-02-20T12:00:00","modified_gmt":"2025-02-20T12:00:00","slug":"a-la-decouverte-du-microbiote-pulmonaire","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.africa-press.net\/senegal\/toutes-les-actualites\/a-la-decouverte-du-microbiote-pulmonaire","title":{"rendered":"A la D\u00e9couverte du Microbiote Pulmonaire"},"content":{"rendered":"<p><span style=\"color: #ff6600\"><strong>Africa-Press &#8211; Senegal. <\/strong><\/span>Les dogmes en me\u0301decine ont la vie dure. Ainsi, \u00ab nous avons longtemps cru qu\u2019un poumon sain e\u0301tait force\u0301ment ste\u0301rile \u00ab , reconnai\u0302t le Pr Genevie\u0300ve He\u0301ry-Arnaud, bacte\u0301riologue spe\u0301cialiste du microbiote pulmonaire au CHU de Brest. Pourtant, en 1899, des travaux e\u0301taient venus contredire ce qui allait devenir un dogme. Une e\u0301tude sur 23 cadavres exempts de maladie pulmonaire avait re\u0301ve\u0301le\u0301 la pre\u0301sence de bacte\u0301ries dans les voies respiratoires. \u00ab La seule erreur de cette e\u0301tude par ailleurs originale fut de conclure que les bacte\u0301ries e\u0301taient pathoge\u0300nes \u00bb, indique-t-elle. Alors qu\u2019il s\u2019agissait de bacte\u0301ries commensales, qui vivent en harmonie avec le sujet.<\/p>\n<p>Il faudra attendre le de\u0301but des anne\u0301es 2000 et l\u2019ave\u0300nement des techniques de se\u0301quenc\u0327age de l\u2019ADN pour accepter ce que l\u2019on pensait inconcevable: la flore pulmonaire existe bel et bien. Pour la premie\u0300re fois, en 2010, des chercheurs de l\u2019Imperial College de Londres (Royaume-Uni) concluent que \u00ab l\u2019arbre bronchique contient un microbiote caracte\u0301ristique \u00ab.<\/p>\n<p><b>Un ro\u0302le primordial pour notre immunite\u0301<\/b><\/p>\n<p>Si cette croyance a tenu aussi longtemps, ce n\u2019est pas un hasard. En effet, les quelque 100 m2 de surface pulmonaire, avec leurs bronches, bronchioles et autres alve\u0301oles, sont dote\u0301s de puissants me\u0301canismes de de\u0301fense pour maintenir une faible charge microbienne et empe\u0302cher les infections. Les voies respiratoires sont constamment nettoye\u0301es par les cils qui de\u0301placent le mucus vers la gorge, et des cellules immunitaires comme les macrophages e\u0301liminent rapidement les bacte\u0301ries.<\/p>\n<p>De plus, l\u2019exploration de ce microbiote exige des me\u0301thodes nettement plus invasives que pour le microbiote intestinal. \u00ab Nous avons recours a\u0300 des lavages broncho-alve\u0301olaires [introduction d\u2019un liquide ste\u0301rile dans une partie des poumons puis re\u0301cupe\u0301ration de ce liquide pour analyse] ou a\u0300 des brossages bronchiques [utilisation d\u2019une petite brosse pour collecter des e\u0301chantillons directement sur les voies respiratoires supe\u0301rieures ou infe\u0301rieures], explique Genevie\u0300ve He\u0301ry-Arnaud. E\u0301videmment, cela ne se pratique pas sur des sujets sains. \u00bb Quant aux expectorations, elles permettent certes de collecter du mucus de fac\u0327on plus douce, mais les se\u0301cre\u0301tions sont parfois contamine\u0301es par le microbiote salivaire. Et la quantite\u0301 de micro-organismes venus des voies ae\u0301riennes supe\u0301rieures qui passent dans le poumon demeure un myste\u0300re.<\/p>\n<p>Rien d\u2019e\u0301tonnant donc a\u0300 ce que la renomme\u0301e du microbiote respiratoire n\u2019arrive pas a\u0300 la cheville de son homologue intestinal. Cependant, \u00ab le nombre de publications scientifiques consacre\u0301es a\u0300 ce microbiote a beaucoup augmente\u0301 ces dix dernie\u0300res anne\u0301es, souligne le Pr Jean-Franc\u0327ois Timsit, chercheur a\u0300 l\u2019Inserm. Et me\u0302me si elles ne disent pas toutes la me\u0302me chose, nous avons tout de me\u0302me quelques e\u0301le\u0301ments. \u00bb Premier constat: la population microbienne dans les poumons est de l\u2019ordre de 105, contre 1011 dans nos intestins. Deuxie\u0300me constat: l\u2019essentiel des micro-organismes se trouve dans les bronches.<\/p>\n<p>\u00ab Dans le tissu pulmonaire, du signal bacte\u0301rien a bien e\u0301te\u0301 trouve\u0301 mais nous n\u2019avons pas la preuve que ces bacte\u0301ries sont vivantes \u00ab , pre\u0301cise Genevie\u0300ve He\u0301ry-Arnaud. Toutes les familles de micro-organismes sont malgre\u0301 tout pre\u0301sentes dans ce microbiote: bacte\u0301ries, virus, champignons et arche\u0301es. Il se distingue aussi par sa forte biodiversite\u0301. Mais, le plus surprenant est qu\u2019environ la moitie\u0301 des espe\u0300ces bacte\u0301riennes pre\u0301sentes sont anae\u0301robies [elles se de\u0301veloppent en l\u2019absence d\u2019oxyge\u0300ne]. Si de telles bacte\u0301ries se nichent dans l\u2019organe de la respiration, cela prouve que les poumons peuvent e\u0302tre colonise\u0301s par des micro-organismes provenant notamment d\u2019autres microbiotes (oropharynge\u0301 et intestinal).<\/p>\n<p>Troisie\u0300me certitude: le microbiote pulmonaire joue un ro\u0302le primordial dans notre immunite\u0301. A\u0300 l\u2019instar de la flore intestinale, il stimule et e\u0301duque les cellules immunitaires. Les micro-organismes commensaux occupent l\u2019espace, produisent des substances antimicrobiennes et empe\u0302chent les pathoge\u0300nes de s\u2019installer. De plus, il module la re\u0301ponse immunitaire pour e\u0301viter une inflammation excessive, par exemple lorsque les voies respiratoires sont expose\u0301es a\u0300 des allerge\u0300nes. \u00ab Quelques e\u0301tudes ont e\u0301galement montre\u0301 que ce microbiote influence l\u2019architecture des poumons, le nombre d\u2019alve\u0301oles et donc la capacite\u0301 respiratoire \u00ab , pre\u0301cise Genevie\u0300ve He\u0301ry-Arnaud.<\/p>\n<p><b>Les risques d\u2019un microbiote pulmonaire de\u0301se\u0301quilibre\u0301<\/b><\/p>\n<p>Enfin, comme n\u2019importe quel microbiote, il peut se retrouver en dysbiose. A\u0300 l\u2019origine de ce de\u0301se\u0301quilibre, on peut trouver plusieurs facteurs. Des facteurs environnementaux tout d\u2019abord, tels que le tabac, qui alte\u0300re la composition et la diversite\u0301 de la flore, irrite les voies respiratoires et re\u0301duit l\u2019efficacite\u0301 des me\u0301canismes de de\u0301fense pulmonaires. Mais aussi la pollution de l\u2019air, qui risque d\u2019affecter l\u2019inte\u0301grite\u0301 de la barrie\u0300re pulmonaire. Un usage important et pre\u0301coce des antibiotiques \u00ab fait aussi des de\u0301ga\u0302ts \u00ab , ajoute-t-elle. Les infections respiratoires, comme la grippe, modifient e\u0301galement la composition du microbiote en e\u0301liminant les bacte\u0301ries be\u0301ne\u0301fiques et en permettant aux micro-organismes pathoge\u0300nes de se multiplier, ce qui peut aggraver l\u2019inflammation. D\u2019ailleurs, \u00ab il existe une relation entre la gravite\u0301 d\u2019une pneumonie et la diversite\u0301 du microbiote \u00ab , souligne Jean-Franc\u0327ois Timsit.<\/p>\n<p>Quelle relation pre\u0301cise\u0301ment ? Quels micro-organismes sont sur le banc des accuse\u0301s ? L\u2019analyse du microbiote permettrait-elle de pre\u0301dire l\u2019efficacite\u0301 des traitements ? Toutes ces questions agitent la communaute\u0301 scientifique. Une e\u0301tude parue en 2020 dans l\u2019American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine, mene\u0301e chez 91 patients admis en soins intensifs pour toutes sortes de pathologies, a par exemple mis en e\u0301vidence que les malades avec une charge bacte\u0301rienne pulmonaire plus e\u0301leve\u0301e passaient plus de jours sous ventilation me\u0301canique. La pre\u0301sence de bacte\u0301ries intestinales dans les poumons e\u0301tait en outre de mauvais pronostic. Bien que pre\u0301liminaires, ces re\u0301sultats donnent de l\u2019espoir aux auteurs de l\u2019e\u0301tude, pour qui \u00ab les diffe\u0301rences dans les bacte\u0301ries pulmonaires aident a\u0300 expliquer qui se re\u0301tablit et qui ne se re\u0301tablit pas. Et si nous ne pouvons pas modifier les ge\u0300nes de nos patients, nous pouvons re\u0301guler leur microbiote. \u00bb<\/p>\n<p>Au-dela\u0300 du pronostic, d\u2019autres perspectives d\u2019application e\u0301mergent. Au CHU de Brest, en collaboration avec une e\u0301quipe Inserm de l\u2019universite\u0301 de Bretagne occidentale, un biomarqueur du microbiote pulmonaire permettant de pre\u0301dire le risque d\u2019infection pulmonaire chez les malades atteints de mucoviscidose a e\u0301te\u0301 identifie\u0301. \u00ab Nous avons de\u0301pose\u0301 un brevet et espe\u0301rons valider ce test pour la fin 2026, a\u0300 l\u2019issue d\u2019une vaste e\u0301tude clinique qui est en cours, de\u0301clare Genevie\u0300ve He\u0301ry-Arnaud. Les enfants a\u0300 risque pourraient alors be\u0301ne\u0301ficier d\u2019une the\u0301rapie cible\u0301e de manie\u0300re pre\u0301coce. \u00bb<\/p>\n<p>Enfin, une cartographie tre\u0300s pre\u0301cise du microbiote pulmonaire pourrait aussi, a\u0300 terme, offrir des pistes de traitement, notamment pour les pneumonies bacte\u0301riennes. L\u2019enjeu est de taille, car du fait de la re\u0301sistance aux antibiotiques, un tiers des 500.000 cas traite\u0301s chaque anne\u0301e a\u0300 l\u2019ho\u0302pital aboutissent a\u0300 un e\u0301chec the\u0301rapeutique. Et les infections a\u0300 pneumocoques pre\u0301sentent un taux de mortalite\u0301 de 10 a\u0300 30 % selon les e\u0301tudes. L\u2019issue pourrait-elle venir du microbiote pulmonaire ?<\/p>\n<p><b>Des pneumonies lie\u0301es a\u0300 une baisse de certaines bacte\u0301ries<\/b><\/p>\n<p>Des travaux publie\u0301s en 2023 dans Nature medicine par une e\u0301quipe du CHU de Nantes ont de\u0301ja\u0300 montre\u0301 que la re\u0301duction de l\u2019abondance de quatre types de bacte\u0301ries e\u0301tait lie\u0301e a\u0300 des pneumonies graves ne\u0301cessitant une assistance respiratoire. \u00ab Maintenant que nous avons identifie\u0301 ces espe\u0300ces, nous allons e\u0301tudier les fonctions me\u0301taboliques qu\u2019elles assurent et la fac\u0327on dont elles fluctuent avec le devenir clinique du patient \u00ab , explique Jean-Franc\u0327ois Timsit, qui a cofonde\u0301 en 2023 ce projet nomme\u0301 Phenomenon.<\/p>\n<p>En janvier, les inclusions de quelque 600 patients souffrant de pneumonies le\u0301ge\u0300res ou se\u0301ve\u0300res vont commencer. A\u0300 partir des e\u0301chantillons pre\u0301leve\u0301s, les chercheurs vont de\u0301crire en de\u0301tail le contenu et les proprie\u0301te\u0301s des ge\u0300nes de re\u0301sistance dans le microbiote des patients et e\u0301valuer la possibilite\u0301 que ces ge\u0300nes pre\u0301sents dans les bacte\u0301ries du microbiote pulmonaire soient transmis aux bacte\u0301ries pathoge\u0300nes. Ce qui expliquerait les e\u0301checs de traitement.<\/p>\n<p>Ensuite, ces bacte\u0301ries commensales naturellement re\u0301sistantes aux antibiotiques pourraient e\u0302tre utilise\u0301es comme probiotique. La strate\u0301gie peut parai\u0302tre contre-intuitive mais lors d\u2019une antibiothe\u0301rapie, le traitement de\u0301truit non seulement les bacte\u0301ries pathoge\u0300nes mais aussi celles qui prote\u0300gent le microbiote. En introduisant ces bacte\u0301ries commensales, il serait alors possible de prote\u0301ger le microbiote tout en traitant l\u2019infection.<\/p>\n<p><b>Les grands espoirs du poumon miniature<\/b><\/p>\n<p>Les animaux de laboratoire ne sont pas d\u2019une grande aide pour e\u0301tudier les poumons. En effet, les mode\u0300les actuels ne refle\u0300tent pas bien les poumons humains, qui ont une structure complexe et qui fonctionnent dans un environnement ou\u0300 l\u2019air et le liquide interagissent. Des chercheurs de l\u2019Inserm ont donc cre\u0301e\u0301 un mode\u0300le de poumon miniature en 3D, appele\u0301 bronchioi\u0308de.<\/p>\n<p>Il ressemble aux bronches humaines: \u00ab Le grand de\u0301fi e\u0301tait de parvenir a\u0300 ge\u0301ne\u0301rer une structure cylindrique tubulaire pour que les organoi\u0308des pulmonaires commencent a\u0300 ressembler a\u0300 des bronchioles \u00ab , explique Isabelle Dupin, professeure de physiologie au Centre de recherche cardiothoracique de Bordeaux. Ce petit bijou contient des cellules pulmonaires humaines cilie\u0301es et productrices de mucus dans lequel on peut introduire de l\u2019air, du liquide ou des virus pour reproduire des maladies comme la bronchopneumopathie chronique (BPCO). Et, a\u0300 terme, tester de nouveaux me\u0301dicaments.<\/p>\n<p><strong>Pour plus d&rsquo;informations et d&rsquo;analyses sur la <span style=\"color: #ff6600\">Senegal<\/span>, suivez <span style=\"color: #ff6600\">Africa-Press<span style=\"color: #ff6600\"><\/span><\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Africa-Press &#8211; Senegal. Les dogmes en me\u0301decine ont la vie dure. Ainsi, \u00ab nous avons longtemps cru qu\u2019un poumon sain e\u0301tait force\u0301ment ste\u0301rile \u00ab , reconnai\u0302t le Pr Genevie\u0300ve He\u0301ry-Arnaud, bacte\u0301riologue spe\u0301cialiste du microbiote pulmonaire au CHU de Brest. Pourtant, en 1899, des travaux e\u0301taient venus contredire ce qui allait devenir un dogme. 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