{"id":101386,"date":"2026-04-25T14:36:13","date_gmt":"2026-04-25T14:36:13","guid":{"rendered":"https:\/\/www.africa-press.net\/tchad\/politique\/elephants-dafrique-plus-grand-sequencage-de-genome"},"modified":"2026-04-25T15:26:10","modified_gmt":"2026-04-25T15:26:10","slug":"elephants-dafrique-plus-grand-sequencage-de-genome","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.africa-press.net\/tchad\/toutes-les-actualites\/elephants-dafrique-plus-grand-sequencage-de-genome","title":{"rendered":"E\u0301le\u0301phants d’Afrique: Plus Grand Se\u0301quenc\u0327age de Ge\u0301nome"},"content":{"rendered":"

Africa-Press – Tchad. <\/strong><\/span>Jusqu\u2019a\u0300 pre\u0301sent, nous disposions de plus de donne\u0301es ge\u0301nomiques sur le mammouth, disparu il y a pre\u0300s de 4 000 ans, que sur les e\u0301le\u0301phants vivants, et j\u2019ai de\u0301cide\u0301 de changer cela,\u201d se souvient Patri\u0301cia Pec\u030cnerova\u0301, chercheuse a\u0300 l\u2019Universite\u0301 de Copenhague. Il y a plus de cinq ans, elle entame avec Alfred Roca, professeur spe\u0301cialiste de ces pachydermes, ce qui se re\u0301ve\u0300lera e\u0302tre le plus grand se\u0301quenc\u0327age ge\u0301nomique sur les e\u0301le\u0301phants d\u2019Afrique. \u201cNous avons se\u0301quence\u0301 l’inte\u0301gralite\u0301 de leur code ge\u0301ne\u0301tique,\u201d se fe\u0301licite-t-elle. Et leurs re\u0301sultats, publie\u0301s dans la revue Nature Communications, sont inquie\u0301tants. Les chercheurs ont repe\u0301re\u0301 chez l\u2019e\u0301le\u0301phant d\u2019Afrique plusieurs processus qui se sont e\u0301galement de\u0301roule\u0301s chez le mammouth avant son extinction, notamment la fragmentation de leur habitat et l\u2019isolement des populations.<\/p>\n

Savane et fore\u0302t: deux espe\u0300ces d\u2019e\u0301le\u0301phants bien distinctes<\/b><\/p>\n

Pour mener a\u0300 bien leur e\u0301tude, l\u2019e\u0301quipe d\u2019Alfred Roca et Patri\u0301cia Pec\u030cnerova\u0301 a analyse\u0301 232 ge\u0301nomes complets d\u2019e\u0301le\u0301phants de savane et de fore\u0302t, issus d\u2019une biobanque et provenant de 17 pays africains. Il existe en effet deux espe\u0300ces d\u2019e\u0301le\u0301phants d\u2019Afrique que l\u2019on distingue en fonction de leur habitat, mais qui s\u2019hybrident parfois. \u201cElles sont ge\u0301ne\u0301tiquement tre\u0300s diffe\u0301rentes\u201d, explique Alfred Roca, pour Sciences et Avenir. \u201cLeurs quatre millions d’anne\u0301es de se\u0301paration sont comparables a\u0300 la divergence entre les lions et les tigres.\u201d Actuellement, les e\u0301le\u0301phants de savane sont plus nombreux que les e\u0301le\u0301phants de fore\u0302t, bien que leur diversite\u0301 ge\u0301ne\u0301tique soit infe\u0301rieure, d\u2019apre\u0300s les re\u0301sultats de cette e\u0301tude: \u201cil est possible qu’une proportion plus faible de ma\u0302les se reproduise chez les e\u0301le\u0301phants de savane par rapport aux e\u0301le\u0301phants de fore\u0302t.\u201d<\/p>\n

Au cours des deux derniers sie\u0300cles, les e\u0301le\u0301phants ont subi une pression conside\u0301rable due aux activite\u0301s anthropiques: la chasse pour l\u2019ivoire et l\u2019augmentation de la population humaine. \u201cEn raison de l\u2019histoire coloniale, ces processus se sont intensifie\u0301s dans plusieurs re\u0301gions d\u2019Afrique a\u0300 des e\u0301poques et a\u0300 des e\u0301chelles diffe\u0301rentes. C’est pourquoi on observe aujourd’hui des sche\u0301mas d’impact varie\u0301s sur les populations d’e\u0301le\u0301phants\u201d, e\u0301claire Patri\u0301cia Pec\u030cnerova\u0301 lors d’une interview pour Sciences et Avenir. En particulier, la fragmentation de leur habitat par des infrastructures humaines entrave leurs de\u0301placements. \u201cLes e\u0301le\u0301phants se de\u0301placent sur de tre\u0300s longues distances car la nourriture et l’eau sont disperse\u0301es et saisonnie\u0300res\u201d, note Alfred Roca. \u201cLes individus capables de parcourir de plus longues distances avaient plus de chances de survivre et ont donc e\u0301te\u0301 se\u0301lectionne\u0301s positivement au cours de l\u2019e\u0301volution.\u201d Cette mobilite\u0301 leur permet e\u0301galement d’e\u0301viter d’e\u0301puiser les ressources locales et permet aux ma\u0302les de se de\u0301placer d’un groupe a\u0300 l’autre, pre\u0301servant ainsi la diversite\u0301 ge\u0301ne\u0301tique. Leur capacite\u0301 a\u0300 parcourir de longues distances prote\u0300ge donc les e\u0301le\u0301phants contre les ale\u0301as climatiques comme la se\u0301cheresse et ame\u0301liore aussi leur reproduction. Les chercheurs ont donc analyse\u0301 les conse\u0301quences de leur isolement sur leur ge\u0301nome.<\/p>\n

Diversite\u0301 ge\u0301ne\u0301tique et consanguinite\u0301<\/b><\/p>\n

Au lieu d\u2019analyser les e\u0301chantillons a\u0300 l’aide de marqueurs ge\u0301ne\u0301tiques traditionnels, comme l’ADN mitochondrial, les chercheurs ont choisi de se\u0301quencer inte\u0301gralement le code ge\u0301ne\u0301tique des e\u0301le\u0301phants d’Afrique. Une me\u0301thode laborieuse mais aussi beaucoup plus pre\u0301cise. Ils constatent une perte de diversite\u0301 ge\u0301ne\u0301tique importante dans deux re\u0301gions recule\u0301es du nord-est de l\u2019Afrique, en Erythre\u0301e et en Ethiopie. Et qui dit perte de diversite\u0301 ge\u0301ne\u0301tique dit diminution de leur capacite\u0301 a\u0300 s\u2019adapter aux changements, climatiques par exemple, et a\u0300 re\u0301sister aux maladies. Entoure\u0301s d\u2019habitations et de zones agricoles, ces e\u0301le\u0301phants vivent a\u0300 plus de 400 kilome\u0300tres des autres troupeaux. Et cet isolement dure depuis plusieurs de\u0301cennies: \u201cEn E\u0301rythre\u0301e, on suppose que la plupart des e\u0301le\u0301phants ont disparu au de\u0301but du XXe sie\u0300cle et qu\u2019une seule population, a\u0300 Gash-Barka, a surve\u0301cu. Ces e\u0301le\u0301phants, tout comme ceux d\u2019E\u0301thiopie, ont subi de nouveaux de\u0301clins au cours du XXe sie\u0300cle, avec une diminution constante due a\u0300 la chasse a\u0300 l\u2019ivoire et a\u0300 l\u2019expansion des infrastructures humaines et de l\u2019agriculture.\u201d A l\u2019ouest, se dessine un sche\u0301ma similaire mais plus nuance\u0301. La diversite\u0301 ge\u0301ne\u0301tique des troupeaux est e\u0301tonnamment e\u0301leve\u0301e. \u201cEn re\u0301alite\u0301, elle te\u0301moigne de l\u2019hybridation des e\u0301le\u0301phants de fore\u0302t et de savane dans cette zone\u201d, indique Patri\u0301cia Pec\u030cnerova\u0301.<\/p>\n

Peut-on en conclure qu\u2019ils sont en bonne sante\u0301? Pas vraiment. Pour y voir plus clair, il faut observer un autre indicateur de la sante\u0301 ge\u0301ne\u0301tique d\u2019une espe\u0300ce: la consanguinite\u0301. Si les e\u0301le\u0301phants e\u0301vitent ge\u0301ne\u0301ralement de s\u2019accoupler entre parents proches, il arrive que la situation se produise au sein de troupeaux restreints et isole\u0301s. \u201cNous pouvons alors analyser leur ge\u0301nome pour savoir dans quelle mesure leur code ge\u0301ne\u0301tique a perdu en diversite\u0301, car certaines parties ont e\u0301te\u0301 he\u0301rite\u0301es du me\u0302me ance\u0302tre\u201d, ajoute la chercheuse. Et les re\u0301sultats sont sans e\u0301quivoque: qu\u2019il s\u2019agisse des e\u0301le\u0301phants de savane et de fore\u0302t du nord-ouest de l’Afrique ou des e\u0301le\u0301phants de savane des re\u0301gions extre\u0302mes du nord-est de l’E\u0301thiopie et de l’E\u0301rythre\u0301e, ils pre\u0301sentent des niveaux de consanguinite\u0301 tre\u0300s e\u0301leve\u0301s.<\/p>\n

L\u2019hybridation n\u2019est pas un avantage e\u0301volutif<\/b><\/p>\n

En Afrique de l’Ouest, les e\u0301le\u0301phants de savane pre\u0301sentent un degre\u0301 d\u2019hybridation plus e\u0301leve\u0301 que sur le reste du continent. \u201cOn ne sait pas exactement a\u0300 quel point les humains ont pu contribuer a\u0300 ce phe\u0301nome\u0300ne, qui a peut-e\u0302tre e\u0301te\u0301 accentue\u0301 par la chasse et la destruction de l’habitat\u201d, rappelle Alfred Roca. Toutefois, cet apport de nouveaux ge\u0300nes ne semble pas e\u0302tre un avantage e\u0301volutif pour les e\u0301le\u0301phants d\u2019Afrique. Malgre\u0301 la pre\u0301sence d\u2019une zone hybride, la plupart des populations de savane ne be\u0301ne\u0301ficient que d’un flux ge\u0301ne\u0301tique tre\u0300s limite\u0301 provenant des e\u0301le\u0301phants de fore\u0302t, souvent infe\u0301rieur a\u0300 1 %. \u201cCela sugge\u0300re que les hybrides ont peu contribue\u0301 au flux ge\u0301ne\u0301tique entre les espe\u0300ces, peut-e\u0302tre en raison d’une valeur se\u0301lective re\u0301duite\u201d, ajoute le chercheur. Cette de\u0301couverte ame\u0300ne les auteurs de l\u2019e\u0301tude a\u0300 questionner les ope\u0301rations de transfert d\u2019e\u0301le\u0301phants hybrides visant a\u0300 apporter de nouveaux ge\u0300nes au sein de troupeaux restreints et isole\u0301s: \u201cil serait donc peu judicieux de les utiliser comme populations sources pour des transferts lorsque des populations intactes d’e\u0301le\u0301phants de savane sont disponibles a\u0300 cette fin\u00a0\u00bb, conclut Alfred Roca.<\/p>\n

Aujourd\u2019hui la capacite\u0301 des e\u0301le\u0301phants a\u0300 retrouver leur diversite\u0301 ge\u0301ne\u0301tique de\u0301pend d\u2019un facteur cle\u0301: leur mobilite\u0301. En Afrique australe, l\u2019aire de conservation de Kavango-Zambe\u0300ze engage justement cinq pays dans la protection des paysages afin de pre\u0301server les de\u0301placements de ces grands mammife\u0300res. Et cette action porte de\u0301ja\u0300 ses fruits puisque les populations d\u2019e\u0301le\u0301phants de la re\u0301gion sont interconnecte\u0301es et disposent d\u2019une grande diversite\u0301 ge\u0301ne\u0301tique.<\/p>\n

Pour plus d’informations et d’analyses sur la Tchad<\/span>, suivez Africa-Press<\/span><\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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